ゲノムサイズ

DNA が持っている塩基対の数

生物のゲノムは,( ある特定の環境下で ) その表現型がどのように発現するかを決定する遺伝子の完全なセットである。我々のような 2 倍体生物は 2 セットのゲノムをもつ。1 つは母親から,他の 1 つは父親から受け継いだものである。

ゲノムサイズ ( 半数体 )
塩基対 遺伝子 注釈
phi-X 174 5,386 10 大腸菌に感染するウイルス
ヒトミトコンドリア 16,569 37
EBウイルス
Epstein-Barr virus (EBV)
172,282 80 単球増加症を起こす
ギラーディア・シータの核変質体 551,264 511 古代,他の真核生物によって貪食された紅藻 ( 真核生物 ) のゲノムの残存物
マイコプラズマ・ジェニタリウム
Mycoplasma genitalium
580,073 483 最小の生物である マイコプラズマ の 3 種類
ウレアプラズマ・ウレアリチカム
Ureaplasma urealyticum
751,719 652
マイコプラズマ・ニュウモニエ
Mycoplasma pneumoniae
816,394 680
クラミジア・トラコマチス
Chlamydia trachomatis
1,042,519 936 よく見られる性病 ( STD ) の原因菌
リケッチア・プロウァツェキ Rickettsia prowazekii 1,111,523 834 発疹チフス( 病原体がシラミによって媒介される )を引き起こす細菌
トレポネマ・パリズム
Treponema pallidum
1,138,011 1,039 梅毒( 循環器系ないし中枢神経系まで侵される性病 )を起こす細菌
リケッチア・コロリー
Rickettsia conorii
1,268,755 1,374 地中海熱の原因菌
ボレリア・ブルグドルフェリー Borrelia burgdorferi 1.44 x 106 1,738 ライム病( ダニを媒介とする炎症性疾患 )の原因菌
Aquifex aeolicus 1,551,335 1,749 イエローストーン国立公園の温泉から分離された菌
Thermoplasma acidophilum 1,564,905 1,509 細胞壁をもたない古細菌
カンピロバクター・ジェジュニ
Campylobacter jejuni
1,641,481 1,708 食中毒の原因菌
ヘリコバクター・ピロリ
Helicobacter pylori
1,667,867 1,589 ストレスや食品以外の胃潰瘍の原因菌
Methanococcus jannaschii 1,664,970 1,783 これらの単細胞性前核細胞は外見的には典型的な細菌であるが,その遺伝子は細菌や真核生物のものと大きく異なる。したがって,第3の生物界に分類され 古細菌 と呼ばれる。
エーロパイラム・パーニックス
Aeropyrum pernix
1,669,695 1,885
パイロコッカス・ホリコシイ
Pyrococcus horikoshii
1,738,505 1,994
メタノバクテリア好熱好酸菌
Methanobacterium thermoautotrophicum
1,751,377 2,008
インフルエンザ菌
Haemophilus influenzae
1,830,138 1,738 中耳感染を起こす原因菌
Thermotoga maritima 1,860,725 1,879 海生の細菌
肺炎連鎖球菌
Streptococcus pneumoniae
2,160,837 2,236 グリフィスによって形質転換が最初にこの菌で発見され,エーブリーによってこの形質転換が DNA によることが見いだされた。
Archaeoglobus fulgidus 2,178,400 2,437 古細菌の 1 種
髄膜炎菌
Neisseria meningitidis
2,184,406 2,185 Group A; 発展途上国における髄膜炎の原因菌
髄膜炎菌
Neisseria meningitidis
2,272,351 2,221 Group B; 米国における髄膜炎の最も多い原因菌
エンセファリトゾーン・カニキュリ
Encephalitozoon cuniculi
2,507,519 1,997 さらに 69 個の RNA 遺伝子; 寄生する真核細胞
Xylella fastidiosa 2,679,305 2,834 さらに 66 個以上の遺伝子をもつ 2 つのプラスミドをもつ
リステリア・モノサイトゲネス
Listeria monocytogenes
2,944,528 2,926 これらの2,853 個はタンパク質,他は RNA をコード化している
デイノコックス・ラジオデュランス
Deinococcus radiodurans
3,284,156 3,187 放射線障害に対し抵抗性を示す
Synechocystis 3,573,470 4,003 海生の前核生物,シアノバクテリア の 1 種
コレラ菌
Vibrio cholerae
4,033,460 3,890 2 本の染色体の中に収まる
ヒト型結核菌
Mycobacterium tuberculosis
4,411,532 3,959 結核の原因菌
ライ菌
Mycobacterium leprae
3,268,203 1,604 ハンセン病の原因菌
古草菌
Bacillus subtilis
4,214,814 4,779 バクテリウム属
大腸菌 E. coli 4,639,221 4,377 これらのうち 4,290 個の遺伝子はタンパク質を,残りは tRNA をコード化している
アグロバクテリウムツメファシエンス
Agrobacterium tumefaciens
4,674,062 5,419 遺伝子組み換え植物を作出する際の有用なベクター;Sinorhizobium meliloti と多くの遺伝子を共有している
チフス菌 Salmonella enterica var Typhi 4,809,037 4,395 さらに,372 個の遺伝子をもつプラスミド;腸チフスの原因菌
ネズミチフス菌
Salmonella enterica var Typhimurium
4,857,432 4,450 さらに, 102 個の遺伝子をもつ 1 つのプラスミド
ペスト菌
Yersinia pestis
4,826,100 4,052 1 本の染色体上と 3 つのプラスミドにある
Schizosaccharomyces pombe 12,462,637 4,929 分裂酵母,以下の 5 つの前核生物より遺伝子が少ない真核生物
大腸菌 O157 5.44 x 106 5,416 ベロ毒素と呼ばれる赤痢菌様毒素を産生する腸管出血性大腸菌
Ralstonia solanacearum 5,810,922 5,129 多くの植物に病気を起こす土壌細菌; 1 個の巨大なプラスミド上に 1681 個の遺伝子がある
緑膿菌 Pseudomonas aeruginosa 6.3 x 106 5,570 日和見感染症を起こす
Streptomyces coelicolor 6,667,507 7,842 これと同族の放射菌は我々に多くの抗生物質を提供してくれる
シノリゾリウム・メリロッティ
Sinorhizobium meliloti
6,691,694 6,204 ゲノムは 1 本の染色体と 2 つの大きなプラスミドからなる
サッカロマイセス・セレヴィシエ
Saccharomyces cerevisiae
12,495,682 5,770 出芽酵母,真核細胞
プラスモジウム・ファルシパリウム
Plasmodium falciparum
22,853,754 5,268 さらに, 53 個の RNA 遺伝子がある。マラリアの原因菌
線虫
Caenorhabditis elegans
95.5 x 106 19,820 はじめて DNA 配列が決定された多細胞生物
シロイヌナズナ
Arabidopsis thaliana
115,409,949 25,498 顕花植物
ショウジョウバエ
Drosophila melanogaster
122,653,977 13,472 1910 年モーガンの白目の発見以来,遺伝学の実験に用いられることで有名
ハマダラカ Anopheles gambiae 278,244,063 13,683 マラリアを媒介する蚊の種類
上記のゲノムはすでに配列が決定されている。下記についてはまだ完了していないが,値は推定値である。ヒト,フグ,コメの遺伝子配列は明らかになったが,タンパク質をコードする遺伝子の特定が今後残されている。 [ 詳細についてはこちら ]
ヒト 3.3 x 109 ~32,000 Cold Spring Harbor Laboratory では "Genesweep" というヒトゲノムの正確な遺伝子数を当てるコンテストが企画されている。現在のところ,27,462 個から 153,478 個の範囲である。あなたも参加してみませんか?http://www.ensembl.org/genesweep.html
フグ 3.65 x 108 ~38,000 これまで 31,059 個の遺伝子が決定されているが,ゲノムの約 5% がまだである。フグは我々と同じぐらいの遺伝子数をもつが,その多くは遺伝子としての役割をもたず,最終のゲノム数は我々の 1/10 位である。
コメ 4.3 x 108 30,000-55,000
両生類 109 - 1011 ?
Psilotum nudum 2.5 x 1011 ? シダの 1 種

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April 1, 2010